El Sistema de Salud requiere de un sistema de información integrado, diseñado para acompañar el proceso de atención y las decisiones políticas en todos los niveles de atención.

Los datos básicos son producidos en los servicios de salud. Estos circulan por distintos flujos con nodos de concentración y análisis en las regiones y en áreas centrales del Ministerio de Salud como epidemiología, estadística, programas provinciales y proyectos especiales.

Se ofrecen indicadores, reportes e informes de situación, cuyo objetivo principal es detectar logros y dificultades que se presentan en los procesos de trabajo en salud, aportando a la toma de decisiones y la rendición de cuentas a la ciudadanía. El Ministerio de Salud sólo difunde datos agrupados por región, departamento o servicio, con base en las normativas vigentes en torno al secreto estadístico, los derechos del paciente o el habeas data.